Protein–RNA interactions for Protein: Q13332

PTPRS, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, humanhuman

Predictions only

Length 1,948 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRSQ13332 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRSQ13332 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRSQ13332 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRSQ13332 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRSQ13332 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRSQ13332 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRSQ13332 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRSQ13332 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRSQ13332 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRSQ13332 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRSQ13332 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRSQ13332 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRSQ13332 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRSQ13332 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRSQ13332 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRSQ13332 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRSQ13332 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRSQ13332 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRSQ13332 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRSQ13332 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRSQ13332 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRSQ13332 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRSQ13332 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRSQ13332 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRSQ13332 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRSQ13332 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRSQ13332 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRSQ13332 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRSQ13332 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRSQ13332 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRSQ13332 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRSQ13332 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRSQ13332 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRSQ13332 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRSQ13332 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRSQ13332 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRSQ13332 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRSQ13332 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRSQ13332 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRSQ13332 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRSQ13332 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRSQ13332 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRSQ13332 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRSQ13332 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRSQ13332 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRSQ13332 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRSQ13332 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRSQ13332 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRSQ13332 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRSQ13332 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRSQ13332 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRSQ13332 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRSQ13332 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRSQ13332 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRSQ13332 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRSQ13332 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRSQ13332 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRSQ13332 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRSQ13332 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRSQ13332 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRSQ13332 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRSQ13332 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRSQ13332 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRSQ13332 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRSQ13332 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRSQ13332 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRSQ13332 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRSQ13332 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRSQ13332 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRSQ13332 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRSQ13332 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRSQ13332 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRSQ13332 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRSQ13332 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRSQ13332 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRSQ13332 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRSQ13332 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRSQ13332 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRSQ13332 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRSQ13332 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRSQ13332 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRSQ13332 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRSQ13332 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRSQ13332 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRSQ13332 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRSQ13332 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRSQ13332 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRSQ13332 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRSQ13332 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRSQ13332 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRSQ13332 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRSQ13332 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRSQ13332 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRSQ13332 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRSQ13332 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRSQ13332 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRSQ13332 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRSQ13332 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRSQ13332 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRSQ13332 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms