Protein–RNA interactions for Protein: Q13285

NR5A1, Steroidogenic factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR5A1Q13285 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NR5A1Q13285 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
NR5A1Q13285 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NR5A1Q13285 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NR5A1Q13285 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NR5A1Q13285 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NR5A1Q13285 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NR5A1Q13285 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NR5A1Q13285 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
NR5A1Q13285 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NR5A1Q13285 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NR5A1Q13285 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NR5A1Q13285 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NR5A1Q13285 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
NR5A1Q13285 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NR5A1Q13285 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NR5A1Q13285 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NR5A1Q13285 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NR5A1Q13285 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
NR5A1Q13285 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NR5A1Q13285 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NR5A1Q13285 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NR5A1Q13285 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NR5A1Q13285 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NR5A1Q13285 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NR5A1Q13285 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NR5A1Q13285 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NR5A1Q13285 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NR5A1Q13285 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NR5A1Q13285 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NR5A1Q13285 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NR5A1Q13285 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NR5A1Q13285 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NR5A1Q13285 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NR5A1Q13285 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NR5A1Q13285 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NR5A1Q13285 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NR5A1Q13285 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NR5A1Q13285 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NR5A1Q13285 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NR5A1Q13285 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NR5A1Q13285 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NR5A1Q13285 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NR5A1Q13285 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NR5A1Q13285 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NR5A1Q13285 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
NR5A1Q13285 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NR5A1Q13285 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NR5A1Q13285 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NR5A1Q13285 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NR5A1Q13285 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
NR5A1Q13285 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NR5A1Q13285 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NR5A1Q13285 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NR5A1Q13285 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
NR5A1Q13285 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
NR5A1Q13285 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NR5A1Q13285 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NR5A1Q13285 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NR5A1Q13285 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NR5A1Q13285 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NR5A1Q13285 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NR5A1Q13285 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NR5A1Q13285 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NR5A1Q13285 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NR5A1Q13285 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NR5A1Q13285 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NR5A1Q13285 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NR5A1Q13285 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NR5A1Q13285 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NR5A1Q13285 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NR5A1Q13285 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NR5A1Q13285 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NR5A1Q13285 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NR5A1Q13285 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
NR5A1Q13285 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NR5A1Q13285 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NR5A1Q13285 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NR5A1Q13285 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NR5A1Q13285 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NR5A1Q13285 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NR5A1Q13285 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NR5A1Q13285 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NR5A1Q13285 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
NR5A1Q13285 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NR5A1Q13285 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NR5A1Q13285 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NR5A1Q13285 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NR5A1Q13285 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NR5A1Q13285 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NR5A1Q13285 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
NR5A1Q13285 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
NR5A1Q13285 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
NR5A1Q13285 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NR5A1Q13285 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NR5A1Q13285 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NR5A1Q13285 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NR5A1Q13285 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NR5A1Q13285 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NR5A1Q13285 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms