Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

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Length 749 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SEMA3BQ13214 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SEMA3BQ13214 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SEMA3BQ13214 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SEMA3BQ13214 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SEMA3BQ13214 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SEMA3BQ13214 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SEMA3BQ13214 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SEMA3BQ13214 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SEMA3BQ13214 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SEMA3BQ13214 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SEMA3BQ13214 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SEMA3BQ13214 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SEMA3BQ13214 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SEMA3BQ13214 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SEMA3BQ13214 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SEMA3BQ13214 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SEMA3BQ13214 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SEMA3BQ13214 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SEMA3BQ13214 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SEMA3BQ13214 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SEMA3BQ13214 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SEMA3BQ13214 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SEMA3BQ13214 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SEMA3BQ13214 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SEMA3BQ13214 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SEMA3BQ13214 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SEMA3BQ13214 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SEMA3BQ13214 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SEMA3BQ13214 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SEMA3BQ13214 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SEMA3BQ13214 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SEMA3BQ13214 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SEMA3BQ13214 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SEMA3BQ13214 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SEMA3BQ13214 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SEMA3BQ13214 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SEMA3BQ13214 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SEMA3BQ13214 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SEMA3BQ13214 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SEMA3BQ13214 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SEMA3BQ13214 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SEMA3BQ13214 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
SEMA3BQ13214 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SEMA3BQ13214 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SEMA3BQ13214 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SEMA3BQ13214 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SEMA3BQ13214 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SEMA3BQ13214 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SEMA3BQ13214 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SEMA3BQ13214 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SEMA3BQ13214 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SEMA3BQ13214 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SEMA3BQ13214 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SEMA3BQ13214 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SEMA3BQ13214 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SEMA3BQ13214 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SEMA3BQ13214 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SEMA3BQ13214 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
SEMA3BQ13214 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
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SEMA3BQ13214 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SEMA3BQ13214 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
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