Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
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