Protein–RNA interactions for Protein: Q13085

ACACA, Acetyl-CoA carboxylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACACAQ13085 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms