Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
MKRN3Q13064 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MKRN3Q13064 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MKRN3Q13064 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MKRN3Q13064 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
MKRN3Q13064 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MKRN3Q13064 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
MKRN3Q13064 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MKRN3Q13064 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
MKRN3Q13064 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
MKRN3Q13064 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
MKRN3Q13064 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MKRN3Q13064 LINC00437-201ENST00000414161 791 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MKRN3Q13064 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
MKRN3Q13064 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
MKRN3Q13064 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MKRN3Q13064 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
MKRN3Q13064 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
MKRN3Q13064 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
MKRN3Q13064 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
MKRN3Q13064 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MKRN3Q13064 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
MKRN3Q13064 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
MKRN3Q13064 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MKRN3Q13064 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MKRN3Q13064 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
MKRN3Q13064 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MKRN3Q13064 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MKRN3Q13064 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MKRN3Q13064 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MKRN3Q13064 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
MKRN3Q13064 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
MKRN3Q13064 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MKRN3Q13064 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MKRN3Q13064 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MKRN3Q13064 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MKRN3Q13064 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MKRN3Q13064 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
MKRN3Q13064 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MKRN3Q13064 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
MKRN3Q13064 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
MKRN3Q13064 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
MKRN3Q13064 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
MKRN3Q13064 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
MKRN3Q13064 CFTRP2-201ENST00000634304 199 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
MKRN3Q13064 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MKRN3Q13064 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MKRN3Q13064 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
MKRN3Q13064 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
MKRN3Q13064 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
MKRN3Q13064 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MKRN3Q13064 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MKRN3Q13064 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
MKRN3Q13064 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
MKRN3Q13064 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
MKRN3Q13064 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MKRN3Q13064 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MKRN3Q13064 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MKRN3Q13064 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MKRN3Q13064 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MKRN3Q13064 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MKRN3Q13064 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
MKRN3Q13064 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
MKRN3Q13064 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
MKRN3Q13064 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
MKRN3Q13064 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
MKRN3Q13064 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
MKRN3Q13064 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
MKRN3Q13064 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
MKRN3Q13064 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
MKRN3Q13064 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
MKRN3Q13064 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
MKRN3Q13064 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
MKRN3Q13064 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
MKRN3Q13064 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
MKRN3Q13064 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
MKRN3Q13064 AC012497.1-201ENST00000429392 575 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
MKRN3Q13064 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
MKRN3Q13064 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
MKRN3Q13064 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
MKRN3Q13064 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
MKRN3Q13064 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
MKRN3Q13064 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
MKRN3Q13064 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
MKRN3Q13064 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
MKRN3Q13064 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
MKRN3Q13064 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
MKRN3Q13064 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
MKRN3Q13064 UBE2Q2P6-202ENST00000617217 443 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
MKRN3Q13064 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
MKRN3Q13064 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MKRN3Q13064 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MKRN3Q13064 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MKRN3Q13064 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MKRN3Q13064 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MKRN3Q13064 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
MKRN3Q13064 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
MKRN3Q13064 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
MKRN3Q13064 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MKRN3Q13064 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
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