Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GRIK3Q13003 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GRIK3Q13003 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GRIK3Q13003 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
GRIK3Q13003 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GRIK3Q13003 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GRIK3Q13003 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GRIK3Q13003 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GRIK3Q13003 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GRIK3Q13003 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GRIK3Q13003 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GRIK3Q13003 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GRIK3Q13003 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GRIK3Q13003 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GRIK3Q13003 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GRIK3Q13003 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GRIK3Q13003 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GRIK3Q13003 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GRIK3Q13003 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GRIK3Q13003 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GRIK3Q13003 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GRIK3Q13003 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GRIK3Q13003 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GRIK3Q13003 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GRIK3Q13003 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GRIK3Q13003 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GRIK3Q13003 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GRIK3Q13003 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GRIK3Q13003 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GRIK3Q13003 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GRIK3Q13003 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GRIK3Q13003 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GRIK3Q13003 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GRIK3Q13003 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GRIK3Q13003 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GRIK3Q13003 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GRIK3Q13003 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GRIK3Q13003 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GRIK3Q13003 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GRIK3Q13003 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GRIK3Q13003 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
GRIK3Q13003 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GRIK3Q13003 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GRIK3Q13003 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GRIK3Q13003 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GRIK3Q13003 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GRIK3Q13003 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GRIK3Q13003 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GRIK3Q13003 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
GRIK3Q13003 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GRIK3Q13003 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
GRIK3Q13003 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
GRIK3Q13003 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GRIK3Q13003 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
GRIK3Q13003 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GRIK3Q13003 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
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