Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRIK2Q13002 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
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