Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CNTN1Q12860 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CNTN1Q12860 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CNTN1Q12860 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CNTN1Q12860 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CNTN1Q12860 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CNTN1Q12860 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CNTN1Q12860 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CNTN1Q12860 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CNTN1Q12860 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CNTN1Q12860 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CNTN1Q12860 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CNTN1Q12860 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CNTN1Q12860 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CNTN1Q12860 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CNTN1Q12860 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CNTN1Q12860 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CNTN1Q12860 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CNTN1Q12860 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CNTN1Q12860 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CNTN1Q12860 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CNTN1Q12860 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CNTN1Q12860 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CNTN1Q12860 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CNTN1Q12860 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CNTN1Q12860 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CNTN1Q12860 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CNTN1Q12860 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CNTN1Q12860 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CNTN1Q12860 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CNTN1Q12860 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CNTN1Q12860 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CNTN1Q12860 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CNTN1Q12860 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CNTN1Q12860 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CNTN1Q12860 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CNTN1Q12860 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CNTN1Q12860 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CNTN1Q12860 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CNTN1Q12860 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CNTN1Q12860 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CNTN1Q12860 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CNTN1Q12860 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CNTN1Q12860 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CNTN1Q12860 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CNTN1Q12860 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CNTN1Q12860 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CNTN1Q12860 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CNTN1Q12860 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CNTN1Q12860 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CNTN1Q12860 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CNTN1Q12860 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CNTN1Q12860 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CNTN1Q12860 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CNTN1Q12860 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CNTN1Q12860 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CNTN1Q12860 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CNTN1Q12860 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CNTN1Q12860 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CNTN1Q12860 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CNTN1Q12860 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CNTN1Q12860 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CNTN1Q12860 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CNTN1Q12860 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CNTN1Q12860 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CNTN1Q12860 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
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CNTN1Q12860 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CNTN1Q12860 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CNTN1Q12860 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CNTN1Q12860 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CNTN1Q12860 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CNTN1Q12860 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CNTN1Q12860 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CNTN1Q12860 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CNTN1Q12860 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CNTN1Q12860 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CNTN1Q12860 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CNTN1Q12860 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CNTN1Q12860 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CNTN1Q12860 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CNTN1Q12860 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CNTN1Q12860 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CNTN1Q12860 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CNTN1Q12860 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CNTN1Q12860 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CNTN1Q12860 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CNTN1Q12860 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CNTN1Q12860 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CNTN1Q12860 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CNTN1Q12860 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CNTN1Q12860 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CNTN1Q12860 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CNTN1Q12860 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CNTN1Q12860 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CNTN1Q12860 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CNTN1Q12860 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CNTN1Q12860 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CNTN1Q12860 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
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