Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDG4

SCRN3, Secernin-3, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCRN3Q0VDG4 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCRN3Q0VDG4 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCRN3Q0VDG4 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCRN3Q0VDG4 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCRN3Q0VDG4 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCRN3Q0VDG4 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCRN3Q0VDG4 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCRN3Q0VDG4 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCRN3Q0VDG4 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCRN3Q0VDG4 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCRN3Q0VDG4 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCRN3Q0VDG4 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCRN3Q0VDG4 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCRN3Q0VDG4 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCRN3Q0VDG4 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCRN3Q0VDG4 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCRN3Q0VDG4 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCRN3Q0VDG4 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCRN3Q0VDG4 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCRN3Q0VDG4 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCRN3Q0VDG4 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCRN3Q0VDG4 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCRN3Q0VDG4 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCRN3Q0VDG4 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCRN3Q0VDG4 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCRN3Q0VDG4 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCRN3Q0VDG4 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCRN3Q0VDG4 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCRN3Q0VDG4 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCRN3Q0VDG4 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCRN3Q0VDG4 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCRN3Q0VDG4 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCRN3Q0VDG4 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCRN3Q0VDG4 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCRN3Q0VDG4 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCRN3Q0VDG4 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCRN3Q0VDG4 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCRN3Q0VDG4 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCRN3Q0VDG4 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCRN3Q0VDG4 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCRN3Q0VDG4 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCRN3Q0VDG4 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCRN3Q0VDG4 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCRN3Q0VDG4 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCRN3Q0VDG4 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCRN3Q0VDG4 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCRN3Q0VDG4 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCRN3Q0VDG4 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCRN3Q0VDG4 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCRN3Q0VDG4 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCRN3Q0VDG4 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCRN3Q0VDG4 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCRN3Q0VDG4 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCRN3Q0VDG4 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCRN3Q0VDG4 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCRN3Q0VDG4 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCRN3Q0VDG4 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCRN3Q0VDG4 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCRN3Q0VDG4 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCRN3Q0VDG4 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCRN3Q0VDG4 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCRN3Q0VDG4 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCRN3Q0VDG4 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCRN3Q0VDG4 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCRN3Q0VDG4 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCRN3Q0VDG4 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCRN3Q0VDG4 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCRN3Q0VDG4 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCRN3Q0VDG4 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCRN3Q0VDG4 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCRN3Q0VDG4 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCRN3Q0VDG4 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCRN3Q0VDG4 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCRN3Q0VDG4 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SCRN3Q0VDG4 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCRN3Q0VDG4 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCRN3Q0VDG4 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCRN3Q0VDG4 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCRN3Q0VDG4 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCRN3Q0VDG4 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SCRN3Q0VDG4 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCRN3Q0VDG4 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCRN3Q0VDG4 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCRN3Q0VDG4 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCRN3Q0VDG4 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCRN3Q0VDG4 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCRN3Q0VDG4 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCRN3Q0VDG4 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCRN3Q0VDG4 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCRN3Q0VDG4 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCRN3Q0VDG4 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCRN3Q0VDG4 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCRN3Q0VDG4 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCRN3Q0VDG4 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCRN3Q0VDG4 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCRN3Q0VDG4 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCRN3Q0VDG4 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCRN3Q0VDG4 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCRN3Q0VDG4 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCRN3Q0VDG4 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms