Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
NIPAL4Q0D2K0 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
NIPAL4Q0D2K0 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
NIPAL4Q0D2K0 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NIPAL4Q0D2K0 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NIPAL4Q0D2K0 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NIPAL4Q0D2K0 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NIPAL4Q0D2K0 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NIPAL4Q0D2K0 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NIPAL4Q0D2K0 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NIPAL4Q0D2K0 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NIPAL4Q0D2K0 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NIPAL4Q0D2K0 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NIPAL4Q0D2K0 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
NIPAL4Q0D2K0 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NIPAL4Q0D2K0 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NIPAL4Q0D2K0 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NIPAL4Q0D2K0 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NIPAL4Q0D2K0 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NIPAL4Q0D2K0 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
NIPAL4Q0D2K0 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NIPAL4Q0D2K0 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NIPAL4Q0D2K0 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
NIPAL4Q0D2K0 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NIPAL4Q0D2K0 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NIPAL4Q0D2K0 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NIPAL4Q0D2K0 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NIPAL4Q0D2K0 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NIPAL4Q0D2K0 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NIPAL4Q0D2K0 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NIPAL4Q0D2K0 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NIPAL4Q0D2K0 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NIPAL4Q0D2K0 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NIPAL4Q0D2K0 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NIPAL4Q0D2K0 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NIPAL4Q0D2K0 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NIPAL4Q0D2K0 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NIPAL4Q0D2K0 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NIPAL4Q0D2K0 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NIPAL4Q0D2K0 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NIPAL4Q0D2K0 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NIPAL4Q0D2K0 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NIPAL4Q0D2K0 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NIPAL4Q0D2K0 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NIPAL4Q0D2K0 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NIPAL4Q0D2K0 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NIPAL4Q0D2K0 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NIPAL4Q0D2K0 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NIPAL4Q0D2K0 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NIPAL4Q0D2K0 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NIPAL4Q0D2K0 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NIPAL4Q0D2K0 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NIPAL4Q0D2K0 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NIPAL4Q0D2K0 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NIPAL4Q0D2K0 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NIPAL4Q0D2K0 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NIPAL4Q0D2K0 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
NIPAL4Q0D2K0 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
NIPAL4Q0D2K0 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NIPAL4Q0D2K0 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
NIPAL4Q0D2K0 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NIPAL4Q0D2K0 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
NIPAL4Q0D2K0 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NIPAL4Q0D2K0 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NIPAL4Q0D2K0 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NIPAL4Q0D2K0 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NIPAL4Q0D2K0 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NIPAL4Q0D2K0 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NIPAL4Q0D2K0 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NIPAL4Q0D2K0 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NIPAL4Q0D2K0 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NIPAL4Q0D2K0 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NIPAL4Q0D2K0 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NIPAL4Q0D2K0 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NIPAL4Q0D2K0 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NIPAL4Q0D2K0 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms