Protein–RNA interactions for Protein: Q09428

ABCC8, ATP-binding cassette sub-family C member 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC8Q09428 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ABCC8Q09428 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ABCC8Q09428 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ABCC8Q09428 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ABCC8Q09428 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ABCC8Q09428 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ABCC8Q09428 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ABCC8Q09428 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ABCC8Q09428 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ABCC8Q09428 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ABCC8Q09428 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ABCC8Q09428 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
ABCC8Q09428 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
ABCC8Q09428 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
ABCC8Q09428 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ABCC8Q09428 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ABCC8Q09428 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ABCC8Q09428 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ABCC8Q09428 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
ABCC8Q09428 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ABCC8Q09428 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
ABCC8Q09428 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ABCC8Q09428 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ABCC8Q09428 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ABCC8Q09428 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ABCC8Q09428 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ABCC8Q09428 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ABCC8Q09428 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ABCC8Q09428 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ABCC8Q09428 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ABCC8Q09428 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ABCC8Q09428 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
ABCC8Q09428 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
ABCC8Q09428 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
ABCC8Q09428 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ABCC8Q09428 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
ABCC8Q09428 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ABCC8Q09428 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ABCC8Q09428 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ABCC8Q09428 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ABCC8Q09428 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ABCC8Q09428 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ABCC8Q09428 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ABCC8Q09428 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ABCC8Q09428 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ABCC8Q09428 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ABCC8Q09428 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ABCC8Q09428 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ABCC8Q09428 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ABCC8Q09428 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ABCC8Q09428 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
ABCC8Q09428 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ABCC8Q09428 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ABCC8Q09428 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ABCC8Q09428 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ABCC8Q09428 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ABCC8Q09428 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ABCC8Q09428 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ABCC8Q09428 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ABCC8Q09428 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ABCC8Q09428 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ABCC8Q09428 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ABCC8Q09428 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ABCC8Q09428 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ABCC8Q09428 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ABCC8Q09428 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
ABCC8Q09428 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
ABCC8Q09428 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ABCC8Q09428 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
ABCC8Q09428 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ABCC8Q09428 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ABCC8Q09428 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ABCC8Q09428 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ABCC8Q09428 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ABCC8Q09428 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ABCC8Q09428 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ABCC8Q09428 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ABCC8Q09428 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ABCC8Q09428 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ABCC8Q09428 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ABCC8Q09428 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ABCC8Q09428 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ABCC8Q09428 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ABCC8Q09428 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
ABCC8Q09428 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ABCC8Q09428 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
ABCC8Q09428 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
ABCC8Q09428 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ABCC8Q09428 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ABCC8Q09428 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ABCC8Q09428 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ABCC8Q09428 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ABCC8Q09428 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ABCC8Q09428 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ABCC8Q09428 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ABCC8Q09428 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
ABCC8Q09428 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ABCC8Q09428 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ABCC8Q09428 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ABCC8Q09428 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms