Protein–RNA interactions for Protein: Q07627

KRTAP1-1, Keratin-associated protein 1-1, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-1Q07627 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KRTAP1-1Q07627 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KRTAP1-1Q07627 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KRTAP1-1Q07627 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KRTAP1-1Q07627 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KRTAP1-1Q07627 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
KRTAP1-1Q07627 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
KRTAP1-1Q07627 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KRTAP1-1Q07627 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
KRTAP1-1Q07627 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KRTAP1-1Q07627 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KRTAP1-1Q07627 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KRTAP1-1Q07627 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KRTAP1-1Q07627 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KRTAP1-1Q07627 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
KRTAP1-1Q07627 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
KRTAP1-1Q07627 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KRTAP1-1Q07627 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
KRTAP1-1Q07627 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
KRTAP1-1Q07627 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KRTAP1-1Q07627 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KRTAP1-1Q07627 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KRTAP1-1Q07627 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KRTAP1-1Q07627 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KRTAP1-1Q07627 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KRTAP1-1Q07627 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KRTAP1-1Q07627 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
KRTAP1-1Q07627 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KRTAP1-1Q07627 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KRTAP1-1Q07627 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KRTAP1-1Q07627 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KRTAP1-1Q07627 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KRTAP1-1Q07627 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KRTAP1-1Q07627 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KRTAP1-1Q07627 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KRTAP1-1Q07627 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KRTAP1-1Q07627 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KRTAP1-1Q07627 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KRTAP1-1Q07627 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KRTAP1-1Q07627 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KRTAP1-1Q07627 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KRTAP1-1Q07627 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
KRTAP1-1Q07627 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KRTAP1-1Q07627 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KRTAP1-1Q07627 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KRTAP1-1Q07627 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KRTAP1-1Q07627 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
KRTAP1-1Q07627 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KRTAP1-1Q07627 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KRTAP1-1Q07627 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
KRTAP1-1Q07627 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KRTAP1-1Q07627 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KRTAP1-1Q07627 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KRTAP1-1Q07627 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
KRTAP1-1Q07627 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KRTAP1-1Q07627 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KRTAP1-1Q07627 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KRTAP1-1Q07627 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KRTAP1-1Q07627 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KRTAP1-1Q07627 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KRTAP1-1Q07627 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KRTAP1-1Q07627 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KRTAP1-1Q07627 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KRTAP1-1Q07627 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KRTAP1-1Q07627 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KRTAP1-1Q07627 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KRTAP1-1Q07627 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KRTAP1-1Q07627 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KRTAP1-1Q07627 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KRTAP1-1Q07627 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KRTAP1-1Q07627 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KRTAP1-1Q07627 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KRTAP1-1Q07627 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KRTAP1-1Q07627 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KRTAP1-1Q07627 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KRTAP1-1Q07627 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KRTAP1-1Q07627 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KRTAP1-1Q07627 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
KRTAP1-1Q07627 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
KRTAP1-1Q07627 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KRTAP1-1Q07627 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KRTAP1-1Q07627 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KRTAP1-1Q07627 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KRTAP1-1Q07627 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KRTAP1-1Q07627 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KRTAP1-1Q07627 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KRTAP1-1Q07627 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
KRTAP1-1Q07627 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KRTAP1-1Q07627 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KRTAP1-1Q07627 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KRTAP1-1Q07627 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
KRTAP1-1Q07627 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
KRTAP1-1Q07627 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
KRTAP1-1Q07627 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KRTAP1-1Q07627 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KRTAP1-1Q07627 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KRTAP1-1Q07627 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
KRTAP1-1Q07627 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KRTAP1-1Q07627 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KRTAP1-1Q07627 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms