Protein–RNA interactions for Protein: Q06710

PAX8, Paired box protein Pax-8, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX8Q06710 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PAX8Q06710 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PAX8Q06710 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PAX8Q06710 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PAX8Q06710 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PAX8Q06710 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PAX8Q06710 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PAX8Q06710 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PAX8Q06710 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PAX8Q06710 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PAX8Q06710 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PAX8Q06710 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PAX8Q06710 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PAX8Q06710 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PAX8Q06710 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PAX8Q06710 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PAX8Q06710 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PAX8Q06710 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PAX8Q06710 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PAX8Q06710 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PAX8Q06710 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PAX8Q06710 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PAX8Q06710 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PAX8Q06710 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PAX8Q06710 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PAX8Q06710 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PAX8Q06710 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PAX8Q06710 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
PAX8Q06710 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
PAX8Q06710 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
PAX8Q06710 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PAX8Q06710 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PAX8Q06710 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PAX8Q06710 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PAX8Q06710 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
PAX8Q06710 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PAX8Q06710 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PAX8Q06710 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PAX8Q06710 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PAX8Q06710 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PAX8Q06710 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PAX8Q06710 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PAX8Q06710 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PAX8Q06710 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PAX8Q06710 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PAX8Q06710 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PAX8Q06710 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PAX8Q06710 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PAX8Q06710 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PAX8Q06710 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PAX8Q06710 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PAX8Q06710 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PAX8Q06710 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PAX8Q06710 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PAX8Q06710 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PAX8Q06710 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PAX8Q06710 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PAX8Q06710 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PAX8Q06710 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PAX8Q06710 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PAX8Q06710 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
PAX8Q06710 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PAX8Q06710 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PAX8Q06710 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PAX8Q06710 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PAX8Q06710 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PAX8Q06710 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PAX8Q06710 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PAX8Q06710 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
PAX8Q06710 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PAX8Q06710 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
PAX8Q06710 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PAX8Q06710 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PAX8Q06710 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PAX8Q06710 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PAX8Q06710 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
PAX8Q06710 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PAX8Q06710 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PAX8Q06710 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PAX8Q06710 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
PAX8Q06710 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PAX8Q06710 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PAX8Q06710 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
PAX8Q06710 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PAX8Q06710 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PAX8Q06710 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PAX8Q06710 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PAX8Q06710 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PAX8Q06710 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
PAX8Q06710 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PAX8Q06710 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PAX8Q06710 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PAX8Q06710 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PAX8Q06710 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PAX8Q06710 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PAX8Q06710 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PAX8Q06710 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PAX8Q06710 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PAX8Q06710 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PAX8Q06710 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms