Protein–RNA interactions for Protein: Q04741

EMX1, Homeobox protein EMX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMX1Q04741 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
EMX1Q04741 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EMX1Q04741 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EMX1Q04741 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EMX1Q04741 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EMX1Q04741 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EMX1Q04741 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EMX1Q04741 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EMX1Q04741 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EMX1Q04741 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EMX1Q04741 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EMX1Q04741 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EMX1Q04741 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
EMX1Q04741 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
EMX1Q04741 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EMX1Q04741 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EMX1Q04741 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EMX1Q04741 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EMX1Q04741 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EMX1Q04741 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EMX1Q04741 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EMX1Q04741 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
EMX1Q04741 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EMX1Q04741 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EMX1Q04741 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EMX1Q04741 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EMX1Q04741 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EMX1Q04741 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EMX1Q04741 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EMX1Q04741 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EMX1Q04741 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EMX1Q04741 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EMX1Q04741 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EMX1Q04741 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EMX1Q04741 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EMX1Q04741 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EMX1Q04741 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EMX1Q04741 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EMX1Q04741 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EMX1Q04741 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EMX1Q04741 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EMX1Q04741 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EMX1Q04741 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EMX1Q04741 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EMX1Q04741 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
EMX1Q04741 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EMX1Q04741 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EMX1Q04741 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EMX1Q04741 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EMX1Q04741 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EMX1Q04741 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EMX1Q04741 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EMX1Q04741 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EMX1Q04741 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EMX1Q04741 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EMX1Q04741 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EMX1Q04741 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EMX1Q04741 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EMX1Q04741 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EMX1Q04741 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EMX1Q04741 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EMX1Q04741 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
EMX1Q04741 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EMX1Q04741 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EMX1Q04741 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EMX1Q04741 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EMX1Q04741 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EMX1Q04741 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EMX1Q04741 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EMX1Q04741 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EMX1Q04741 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EMX1Q04741 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EMX1Q04741 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EMX1Q04741 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EMX1Q04741 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EMX1Q04741 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EMX1Q04741 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EMX1Q04741 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EMX1Q04741 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EMX1Q04741 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EMX1Q04741 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EMX1Q04741 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EMX1Q04741 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EMX1Q04741 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EMX1Q04741 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EMX1Q04741 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EMX1Q04741 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EMX1Q04741 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EMX1Q04741 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EMX1Q04741 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EMX1Q04741 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EMX1Q04741 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EMX1Q04741 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EMX1Q04741 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EMX1Q04741 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EMX1Q04741 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EMX1Q04741 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EMX1Q04741 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EMX1Q04741 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EMX1Q04741 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms