Protein–RNA interactions for Protein: Q02223

TNFRSF17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF17Q02223 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms