Protein–RNA interactions for Protein: Q01726

MC1R, Melanocyte-stimulating hormone receptor, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MC1RQ01726 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MC1RQ01726 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MC1RQ01726 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MC1RQ01726 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MC1RQ01726 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MC1RQ01726 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MC1RQ01726 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MC1RQ01726 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MC1RQ01726 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MC1RQ01726 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MC1RQ01726 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MC1RQ01726 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MC1RQ01726 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MC1RQ01726 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MC1RQ01726 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MC1RQ01726 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MC1RQ01726 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MC1RQ01726 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MC1RQ01726 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MC1RQ01726 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MC1RQ01726 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MC1RQ01726 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MC1RQ01726 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MC1RQ01726 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MC1RQ01726 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MC1RQ01726 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MC1RQ01726 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MC1RQ01726 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MC1RQ01726 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
MC1RQ01726 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MC1RQ01726 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MC1RQ01726 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MC1RQ01726 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MC1RQ01726 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MC1RQ01726 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MC1RQ01726 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MC1RQ01726 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MC1RQ01726 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MC1RQ01726 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MC1RQ01726 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MC1RQ01726 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MC1RQ01726 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MC1RQ01726 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MC1RQ01726 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MC1RQ01726 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MC1RQ01726 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MC1RQ01726 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MC1RQ01726 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MC1RQ01726 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MC1RQ01726 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MC1RQ01726 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MC1RQ01726 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MC1RQ01726 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MC1RQ01726 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MC1RQ01726 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MC1RQ01726 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MC1RQ01726 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MC1RQ01726 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MC1RQ01726 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
MC1RQ01726 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MC1RQ01726 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MC1RQ01726 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
MC1RQ01726 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
MC1RQ01726 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MC1RQ01726 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MC1RQ01726 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
MC1RQ01726 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MC1RQ01726 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MC1RQ01726 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MC1RQ01726 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MC1RQ01726 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MC1RQ01726 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MC1RQ01726 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MC1RQ01726 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MC1RQ01726 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MC1RQ01726 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MC1RQ01726 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MC1RQ01726 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MC1RQ01726 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MC1RQ01726 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MC1RQ01726 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MC1RQ01726 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
MC1RQ01726 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
MC1RQ01726 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
MC1RQ01726 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MC1RQ01726 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
MC1RQ01726 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
MC1RQ01726 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
MC1RQ01726 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MC1RQ01726 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MC1RQ01726 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
MC1RQ01726 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MC1RQ01726 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
MC1RQ01726 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
MC1RQ01726 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
MC1RQ01726 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
MC1RQ01726 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
MC1RQ01726 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
MC1RQ01726 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
MC1RQ01726 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms