Protein–RNA interactions for Protein: Q00613

HSF1, Heat shock factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSF1Q00613 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms