Protein–RNA interactions for Protein: P98174

FGD1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD1P98174 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FGD1P98174 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FGD1P98174 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FGD1P98174 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
FGD1P98174 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FGD1P98174 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FGD1P98174 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FGD1P98174 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FGD1P98174 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FGD1P98174 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FGD1P98174 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FGD1P98174 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FGD1P98174 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FGD1P98174 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
FGD1P98174 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FGD1P98174 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FGD1P98174 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
FGD1P98174 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FGD1P98174 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FGD1P98174 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FGD1P98174 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FGD1P98174 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FGD1P98174 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FGD1P98174 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FGD1P98174 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FGD1P98174 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FGD1P98174 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FGD1P98174 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FGD1P98174 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FGD1P98174 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FGD1P98174 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FGD1P98174 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
FGD1P98174 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
FGD1P98174 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FGD1P98174 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
FGD1P98174 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FGD1P98174 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
FGD1P98174 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FGD1P98174 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FGD1P98174 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
FGD1P98174 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
FGD1P98174 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
FGD1P98174 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
FGD1P98174 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
FGD1P98174 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
FGD1P98174 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FGD1P98174 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
FGD1P98174 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FGD1P98174 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
FGD1P98174 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
FGD1P98174 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
FGD1P98174 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
FGD1P98174 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
FGD1P98174 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
FGD1P98174 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
FGD1P98174 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
FGD1P98174 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
FGD1P98174 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
FGD1P98174 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
FGD1P98174 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
FGD1P98174 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
FGD1P98174 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FGD1P98174 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FGD1P98174 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FGD1P98174 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FGD1P98174 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FGD1P98174 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FGD1P98174 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FGD1P98174 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FGD1P98174 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FGD1P98174 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FGD1P98174 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FGD1P98174 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FGD1P98174 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FGD1P98174 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FGD1P98174 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FGD1P98174 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FGD1P98174 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FGD1P98174 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FGD1P98174 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FGD1P98174 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FGD1P98174 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FGD1P98174 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FGD1P98174 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FGD1P98174 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FGD1P98174 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FGD1P98174 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FGD1P98174 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
FGD1P98174 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FGD1P98174 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
FGD1P98174 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FGD1P98174 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FGD1P98174 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FGD1P98174 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FGD1P98174 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FGD1P98174 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FGD1P98174 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FGD1P98174 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FGD1P98174 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FGD1P98174 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms