Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HBBP68871 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HBBP68871 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HBBP68871 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HBBP68871 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HBBP68871 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HBBP68871 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HBBP68871 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HBBP68871 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HBBP68871 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HBBP68871 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HBBP68871 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HBBP68871 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HBBP68871 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HBBP68871 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HBBP68871 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HBBP68871 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HBBP68871 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HBBP68871 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HBBP68871 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HBBP68871 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HBBP68871 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HBBP68871 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
HBBP68871 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
HBBP68871 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
HBBP68871 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
HBBP68871 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
HBBP68871 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
HBBP68871 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
HBBP68871 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
HBBP68871 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
HBBP68871 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
HBBP68871 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
HBBP68871 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
HBBP68871 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HBBP68871 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
HBBP68871 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
HBBP68871 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HBBP68871 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HBBP68871 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HBBP68871 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
HBBP68871 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HBBP68871 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
HBBP68871 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
HBBP68871 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HBBP68871 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
HBBP68871 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
HBBP68871 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HBBP68871 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
HBBP68871 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HBBP68871 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
HBBP68871 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HBBP68871 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
HBBP68871 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
HBBP68871 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
HBBP68871 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
HBBP68871 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
HBBP68871 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HBBP68871 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
HBBP68871 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
HBBP68871 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
HBBP68871 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
HBBP68871 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
HBBP68871 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HBBP68871 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
HBBP68871 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HBBP68871 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HBBP68871 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HBBP68871 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
HBBP68871 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
HBBP68871 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HBBP68871 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HBBP68871 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HBBP68871 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HBBP68871 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
HBBP68871 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
HBBP68871 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
HBBP68871 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
HBBP68871 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
HBBP68871 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
HBBP68871 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
HBBP68871 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HBBP68871 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HBBP68871 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HBBP68871 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HBBP68871 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
HBBP68871 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
HBBP68871 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HBBP68871 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
HBBP68871 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HBBP68871 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
HBBP68871 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HBBP68871 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
HBBP68871 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HBBP68871 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HBBP68871 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HBBP68871 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
HBBP68871 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC12.82□□□□□ -0.36
HBBP68871 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
HBBP68871 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms