Protein–RNA interactions for Protein: P61204

ARF3, ADP-ribosylation factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF3P61204 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARF3P61204 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARF3P61204 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARF3P61204 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ARF3P61204 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARF3P61204 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARF3P61204 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARF3P61204 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARF3P61204 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARF3P61204 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARF3P61204 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARF3P61204 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARF3P61204 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARF3P61204 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARF3P61204 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARF3P61204 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARF3P61204 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARF3P61204 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARF3P61204 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARF3P61204 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARF3P61204 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARF3P61204 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARF3P61204 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARF3P61204 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARF3P61204 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARF3P61204 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARF3P61204 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARF3P61204 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARF3P61204 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARF3P61204 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARF3P61204 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARF3P61204 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARF3P61204 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARF3P61204 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARF3P61204 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARF3P61204 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARF3P61204 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARF3P61204 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARF3P61204 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ARF3P61204 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARF3P61204 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARF3P61204 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ARF3P61204 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARF3P61204 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARF3P61204 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARF3P61204 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARF3P61204 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARF3P61204 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARF3P61204 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARF3P61204 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARF3P61204 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARF3P61204 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARF3P61204 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARF3P61204 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARF3P61204 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARF3P61204 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARF3P61204 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARF3P61204 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARF3P61204 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARF3P61204 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARF3P61204 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARF3P61204 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARF3P61204 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARF3P61204 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARF3P61204 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARF3P61204 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARF3P61204 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARF3P61204 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARF3P61204 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARF3P61204 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARF3P61204 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARF3P61204 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARF3P61204 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARF3P61204 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARF3P61204 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ARF3P61204 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARF3P61204 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARF3P61204 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARF3P61204 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARF3P61204 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARF3P61204 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARF3P61204 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARF3P61204 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARF3P61204 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARF3P61204 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARF3P61204 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARF3P61204 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARF3P61204 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARF3P61204 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARF3P61204 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARF3P61204 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARF3P61204 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARF3P61204 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARF3P61204 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARF3P61204 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARF3P61204 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARF3P61204 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARF3P61204 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARF3P61204 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ARF3P61204 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms