Protein–RNA interactions for Protein: P60900

PSMA6, Proteasome subunit alpha type-6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA6P60900 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSMA6P60900 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMA6P60900 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMA6P60900 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMA6P60900 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMA6P60900 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMA6P60900 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMA6P60900 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMA6P60900 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMA6P60900 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMA6P60900 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMA6P60900 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMA6P60900 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMA6P60900 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMA6P60900 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMA6P60900 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMA6P60900 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMA6P60900 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMA6P60900 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMA6P60900 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMA6P60900 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMA6P60900 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMA6P60900 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMA6P60900 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMA6P60900 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMA6P60900 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMA6P60900 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMA6P60900 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMA6P60900 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMA6P60900 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMA6P60900 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMA6P60900 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMA6P60900 LINC02536-201ENST00000625799 625 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMA6P60900 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMA6P60900 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMA6P60900 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMA6P60900 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMA6P60900 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMA6P60900 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMA6P60900 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMA6P60900 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMA6P60900 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMA6P60900 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMA6P60900 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMA6P60900 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMA6P60900 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMA6P60900 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMA6P60900 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMA6P60900 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMA6P60900 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMA6P60900 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMA6P60900 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMA6P60900 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMA6P60900 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMA6P60900 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMA6P60900 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMA6P60900 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMA6P60900 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMA6P60900 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMA6P60900 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMA6P60900 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMA6P60900 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMA6P60900 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMA6P60900 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMA6P60900 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMA6P60900 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMA6P60900 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMA6P60900 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMA6P60900 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMA6P60900 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMA6P60900 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMA6P60900 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMA6P60900 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMA6P60900 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMA6P60900 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMA6P60900 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMA6P60900 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMA6P60900 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMA6P60900 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMA6P60900 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMA6P60900 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMA6P60900 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMA6P60900 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMA6P60900 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMA6P60900 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMA6P60900 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMA6P60900 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMA6P60900 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMA6P60900 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMA6P60900 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PSMA6P60900 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PSMA6P60900 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PSMA6P60900 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PSMA6P60900 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PSMA6P60900 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PSMA6P60900 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PSMA6P60900 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PSMA6P60900 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PSMA6P60900 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PSMA6P60900 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms