Protein–RNA interactions for Protein: P57796

CABP4, Calcium-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP4P57796 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CABP4P57796 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CABP4P57796 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CABP4P57796 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CABP4P57796 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CABP4P57796 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CABP4P57796 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CABP4P57796 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CABP4P57796 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CABP4P57796 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CABP4P57796 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CABP4P57796 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CABP4P57796 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CABP4P57796 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CABP4P57796 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CABP4P57796 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CABP4P57796 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CABP4P57796 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CABP4P57796 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CABP4P57796 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CABP4P57796 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CABP4P57796 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CABP4P57796 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CABP4P57796 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CABP4P57796 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CABP4P57796 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CABP4P57796 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CABP4P57796 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CABP4P57796 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CABP4P57796 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CABP4P57796 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CABP4P57796 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CABP4P57796 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CABP4P57796 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CABP4P57796 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CABP4P57796 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CABP4P57796 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CABP4P57796 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CABP4P57796 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CABP4P57796 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CABP4P57796 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CABP4P57796 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CABP4P57796 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CABP4P57796 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CABP4P57796 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CABP4P57796 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CABP4P57796 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CABP4P57796 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CABP4P57796 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CABP4P57796 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CABP4P57796 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CABP4P57796 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CABP4P57796 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CABP4P57796 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CABP4P57796 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CABP4P57796 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CABP4P57796 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CABP4P57796 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CABP4P57796 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CABP4P57796 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CABP4P57796 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CABP4P57796 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CABP4P57796 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CABP4P57796 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CABP4P57796 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CABP4P57796 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CABP4P57796 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CABP4P57796 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CABP4P57796 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CABP4P57796 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CABP4P57796 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CABP4P57796 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CABP4P57796 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CABP4P57796 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CABP4P57796 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CABP4P57796 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CABP4P57796 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CABP4P57796 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CABP4P57796 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CABP4P57796 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CABP4P57796 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CABP4P57796 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CABP4P57796 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CABP4P57796 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CABP4P57796 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CABP4P57796 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CABP4P57796 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CABP4P57796 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CABP4P57796 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CABP4P57796 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CABP4P57796 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CABP4P57796 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CABP4P57796 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CABP4P57796 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CABP4P57796 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CABP4P57796 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CABP4P57796 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CABP4P57796 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CABP4P57796 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CABP4P57796 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms