Protein–RNA interactions for Protein: P50549

ETV1, ETS translocation variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV1P50549 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ETV1P50549 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ETV1P50549 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ETV1P50549 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ETV1P50549 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ETV1P50549 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ETV1P50549 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ETV1P50549 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ETV1P50549 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ETV1P50549 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ETV1P50549 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ETV1P50549 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ETV1P50549 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ETV1P50549 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ETV1P50549 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ETV1P50549 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ETV1P50549 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ETV1P50549 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ETV1P50549 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ETV1P50549 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ETV1P50549 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ETV1P50549 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ETV1P50549 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ETV1P50549 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
ETV1P50549 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ETV1P50549 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ETV1P50549 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ETV1P50549 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ETV1P50549 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ETV1P50549 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ETV1P50549 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ETV1P50549 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ETV1P50549 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ETV1P50549 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ETV1P50549 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ETV1P50549 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ETV1P50549 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ETV1P50549 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ETV1P50549 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ETV1P50549 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ETV1P50549 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ETV1P50549 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ETV1P50549 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ETV1P50549 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ETV1P50549 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ETV1P50549 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ETV1P50549 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ETV1P50549 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ETV1P50549 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ETV1P50549 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ETV1P50549 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ETV1P50549 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ETV1P50549 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ETV1P50549 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ETV1P50549 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ETV1P50549 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ETV1P50549 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ETV1P50549 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ETV1P50549 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ETV1P50549 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ETV1P50549 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ETV1P50549 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ETV1P50549 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ETV1P50549 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ETV1P50549 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ETV1P50549 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ETV1P50549 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ETV1P50549 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ETV1P50549 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ETV1P50549 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ETV1P50549 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ETV1P50549 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ETV1P50549 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ETV1P50549 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ETV1P50549 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ETV1P50549 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ETV1P50549 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ETV1P50549 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ETV1P50549 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ETV1P50549 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ETV1P50549 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ETV1P50549 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ETV1P50549 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ETV1P50549 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ETV1P50549 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ETV1P50549 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ETV1P50549 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ETV1P50549 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ETV1P50549 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ETV1P50549 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ETV1P50549 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ETV1P50549 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ETV1P50549 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ETV1P50549 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ETV1P50549 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ETV1P50549 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ETV1P50549 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ETV1P50549 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ETV1P50549 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ETV1P50549 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms