Protein–RNA interactions for Protein: P49790

NUP153, Nuclear pore complex protein Nup153, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP153P49790 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NUP153P49790 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
NUP153P49790 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NUP153P49790 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NUP153P49790 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NUP153P49790 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NUP153P49790 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NUP153P49790 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NUP153P49790 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NUP153P49790 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NUP153P49790 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NUP153P49790 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NUP153P49790 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NUP153P49790 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NUP153P49790 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NUP153P49790 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NUP153P49790 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NUP153P49790 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NUP153P49790 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NUP153P49790 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NUP153P49790 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NUP153P49790 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NUP153P49790 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NUP153P49790 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NUP153P49790 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NUP153P49790 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NUP153P49790 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NUP153P49790 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NUP153P49790 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
NUP153P49790 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NUP153P49790 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NUP153P49790 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NUP153P49790 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NUP153P49790 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NUP153P49790 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NUP153P49790 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NUP153P49790 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NUP153P49790 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NUP153P49790 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NUP153P49790 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NUP153P49790 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NUP153P49790 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
NUP153P49790 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
NUP153P49790 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NUP153P49790 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
NUP153P49790 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NUP153P49790 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NUP153P49790 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NUP153P49790 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NUP153P49790 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NUP153P49790 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NUP153P49790 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NUP153P49790 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NUP153P49790 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NUP153P49790 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
NUP153P49790 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NUP153P49790 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NUP153P49790 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NUP153P49790 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NUP153P49790 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NUP153P49790 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NUP153P49790 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NUP153P49790 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NUP153P49790 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NUP153P49790 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NUP153P49790 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NUP153P49790 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NUP153P49790 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NUP153P49790 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NUP153P49790 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
NUP153P49790 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
NUP153P49790 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NUP153P49790 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
NUP153P49790 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
NUP153P49790 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
NUP153P49790 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
NUP153P49790 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
NUP153P49790 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
NUP153P49790 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NUP153P49790 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NUP153P49790 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NUP153P49790 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NUP153P49790 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NUP153P49790 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NUP153P49790 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NUP153P49790 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NUP153P49790 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NUP153P49790 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
NUP153P49790 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NUP153P49790 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NUP153P49790 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NUP153P49790 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NUP153P49790 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NUP153P49790 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NUP153P49790 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NUP153P49790 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NUP153P49790 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NUP153P49790 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NUP153P49790 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NUP153P49790 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms