Protein–RNA interactions for Protein: P49450

CENPA, Histone H3-like centromeric protein A, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPAP49450 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CENPAP49450 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CENPAP49450 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CENPAP49450 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CENPAP49450 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CENPAP49450 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CENPAP49450 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CENPAP49450 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CENPAP49450 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CENPAP49450 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CENPAP49450 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CENPAP49450 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CENPAP49450 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CENPAP49450 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CENPAP49450 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CENPAP49450 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CENPAP49450 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CENPAP49450 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CENPAP49450 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CENPAP49450 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CENPAP49450 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CENPAP49450 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CENPAP49450 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CENPAP49450 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CENPAP49450 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CENPAP49450 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CENPAP49450 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CENPAP49450 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CENPAP49450 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CENPAP49450 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CENPAP49450 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CENPAP49450 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CENPAP49450 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CENPAP49450 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CENPAP49450 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CENPAP49450 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CENPAP49450 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CENPAP49450 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CENPAP49450 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CENPAP49450 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CENPAP49450 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CENPAP49450 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CENPAP49450 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CENPAP49450 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CENPAP49450 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CENPAP49450 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CENPAP49450 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CENPAP49450 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CENPAP49450 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CENPAP49450 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CENPAP49450 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CENPAP49450 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CENPAP49450 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CENPAP49450 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CENPAP49450 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CENPAP49450 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CENPAP49450 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CENPAP49450 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CENPAP49450 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CENPAP49450 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CENPAP49450 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CENPAP49450 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CENPAP49450 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CENPAP49450 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CENPAP49450 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CENPAP49450 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CENPAP49450 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CENPAP49450 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CENPAP49450 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CENPAP49450 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CENPAP49450 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CENPAP49450 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CENPAP49450 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CENPAP49450 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CENPAP49450 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CENPAP49450 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CENPAP49450 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CENPAP49450 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CENPAP49450 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CENPAP49450 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CENPAP49450 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CENPAP49450 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CENPAP49450 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CENPAP49450 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CENPAP49450 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CENPAP49450 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CENPAP49450 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CENPAP49450 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CENPAP49450 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CENPAP49450 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CENPAP49450 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPAP49450 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPAP49450 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPAP49450 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPAP49450 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPAP49450 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPAP49450 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPAP49450 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPAP49450 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPAP49450 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms