Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
NESP48681 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NESP48681 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
NESP48681 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NESP48681 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NESP48681 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NESP48681 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NESP48681 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NESP48681 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NESP48681 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NESP48681 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NESP48681 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NESP48681 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NESP48681 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NESP48681 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NESP48681 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NESP48681 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NESP48681 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NESP48681 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NESP48681 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
NESP48681 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NESP48681 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NESP48681 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NESP48681 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
NESP48681 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NESP48681 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
NESP48681 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NESP48681 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NESP48681 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NESP48681 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NESP48681 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NESP48681 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NESP48681 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NESP48681 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NESP48681 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NESP48681 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NESP48681 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NESP48681 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NESP48681 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NESP48681 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NESP48681 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NESP48681 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NESP48681 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NESP48681 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NESP48681 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NESP48681 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NESP48681 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NESP48681 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NESP48681 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NESP48681 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NESP48681 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NESP48681 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NESP48681 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NESP48681 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NESP48681 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NESP48681 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NESP48681 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NESP48681 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NESP48681 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
NESP48681 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NESP48681 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NESP48681 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NESP48681 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NESP48681 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NESP48681 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NESP48681 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NESP48681 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NESP48681 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NESP48681 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NESP48681 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NESP48681 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NESP48681 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NESP48681 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NESP48681 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
NESP48681 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NESP48681 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NESP48681 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NESP48681 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NESP48681 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NESP48681 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NESP48681 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NESP48681 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NESP48681 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NESP48681 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NESP48681 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NESP48681 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NESP48681 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NESP48681 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NESP48681 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NESP48681 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NESP48681 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NESP48681 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NESP48681 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NESP48681 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC29.01■■■□□ 2.24
NESP48681 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
NESP48681 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
NESP48681 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
NESP48681 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
NESP48681 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC29.01■■■□□ 2.24
NESP48681 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms