Protein–RNA interactions for Protein: P48539

PCP4, Calmodulin regulator protein PCP4, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCP4P48539 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PCP4P48539 SNX12-202ENST00000374274 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PCP4P48539 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PCP4P48539 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PCP4P48539 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PCP4P48539 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PCP4P48539 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PCP4P48539 PELP1-201ENST00000301396 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PCP4P48539 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PCP4P48539 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PCP4P48539 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PCP4P48539 NR4A1-201ENST00000243050 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PCP4P48539 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PCP4P48539 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PCP4P48539 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PCP4P48539 IKBKB-218ENST00000520835 2403 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PCP4P48539 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PCP4P48539 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PCP4P48539 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PCP4P48539 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PCP4P48539 CACNA1G-203ENST00000358244 7030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PCP4P48539 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PCP4P48539 SMIM10L1-201ENST00000622602 4795 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PCP4P48539 AC134312.1-201ENST00000378417 3468 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PCP4P48539 AC237221.1-202ENST00000563054 2947 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PCP4P48539 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PCP4P48539 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PCP4P48539 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PCP4P48539 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PCP4P48539 PLCB3-201ENST00000279230 4197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PCP4P48539 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PCP4P48539 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PCP4P48539 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PCP4P48539 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PCP4P48539 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PCP4P48539 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PCP4P48539 GALNT16-201ENST00000337827 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PCP4P48539 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PCP4P48539 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PCP4P48539 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PCP4P48539 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PCP4P48539 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PCP4P48539 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PCP4P48539 PER1-211ENST00000581082 4521 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PCP4P48539 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PCP4P48539 HJURP-207ENST00000441687 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PCP4P48539 DPP3-211ENST00000532677 3078 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PCP4P48539 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PCP4P48539 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PCP4P48539 SH3TC1-201ENST00000245105 4226 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PCP4P48539 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PCP4P48539 PNPLA8-208ENST00000453144 3366 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PCP4P48539 MAP2K4P1-202ENST00000602584 2539 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PCP4P48539 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PCP4P48539 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PCP4P48539 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PCP4P48539 RIC1-204ENST00000418622 6658 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PCP4P48539 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PCP4P48539 FAM131B-202ENST00000409346 4295 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PCP4P48539 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PCP4P48539 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PCP4P48539 PRPF4-201ENST00000374198 2787 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PCP4P48539 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PCP4P48539 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PCP4P48539 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PCP4P48539 SEMA3F-201ENST00000002829 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PCP4P48539 SLC6A10P-201ENST00000330048 3846 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PCP4P48539 TMEM147-AS1-205ENST00000590717 3300 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PCP4P48539 MBTD1-204ENST00000586178 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PCP4P48539 LAMB1-203ENST00000393560 2806 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PCP4P48539 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PCP4P48539 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PCP4P48539 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PCP4P48539 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PCP4P48539 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
PCP4P48539 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
PCP4P48539 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PCP4P48539 DPYSL5-207ENST00000614712 5128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PCP4P48539 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PCP4P48539 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PCP4P48539 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PCP4P48539 RAP2B-201ENST00000323534 8351 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.55
PCP4P48539 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
PCP4P48539 PLEKHG6-201ENST00000011684 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
PCP4P48539 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
PCP4P48539 MYNN-201ENST00000349841 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
PCP4P48539 TBC1D24-201ENST00000293970 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PCP4P48539 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PCP4P48539 EPS15L1-202ENST00000455140 3266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PCP4P48539 PTGR2-204ENST00000555228 2543 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PCP4P48539 RUFY4-201ENST00000344321 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PCP4P48539 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
PCP4P48539 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PCP4P48539 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PCP4P48539 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PCP4P48539 MLPH-201ENST00000264605 3823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PCP4P48539 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PCP4P48539 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PCP4P48539 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PCP4P48539 MICAL1-202ENST00000358807 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms