Protein–RNA interactions for Protein: P48507

GCLM, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLMP48507 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GCLMP48507 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GCLMP48507 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GCLMP48507 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
GCLMP48507 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GCLMP48507 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GCLMP48507 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GCLMP48507 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GCLMP48507 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
GCLMP48507 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
GCLMP48507 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GCLMP48507 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
GCLMP48507 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GCLMP48507 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GCLMP48507 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GCLMP48507 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
GCLMP48507 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GCLMP48507 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GCLMP48507 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GCLMP48507 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GCLMP48507 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GCLMP48507 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GCLMP48507 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GCLMP48507 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GCLMP48507 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GCLMP48507 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GCLMP48507 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GCLMP48507 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GCLMP48507 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GCLMP48507 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GCLMP48507 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
GCLMP48507 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GCLMP48507 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GCLMP48507 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GCLMP48507 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GCLMP48507 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GCLMP48507 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GCLMP48507 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
GCLMP48507 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
GCLMP48507 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GCLMP48507 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GCLMP48507 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GCLMP48507 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GCLMP48507 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GCLMP48507 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
GCLMP48507 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GCLMP48507 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GCLMP48507 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GCLMP48507 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GCLMP48507 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GCLMP48507 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GCLMP48507 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GCLMP48507 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GCLMP48507 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GCLMP48507 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GCLMP48507 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GCLMP48507 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GCLMP48507 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GCLMP48507 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GCLMP48507 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GCLMP48507 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GCLMP48507 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GCLMP48507 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GCLMP48507 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GCLMP48507 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GCLMP48507 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GCLMP48507 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GCLMP48507 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GCLMP48507 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GCLMP48507 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GCLMP48507 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GCLMP48507 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GCLMP48507 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GCLMP48507 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GCLMP48507 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GCLMP48507 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GCLMP48507 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
GCLMP48507 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GCLMP48507 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GCLMP48507 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GCLMP48507 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GCLMP48507 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GCLMP48507 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GCLMP48507 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
GCLMP48507 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
GCLMP48507 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GCLMP48507 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GCLMP48507 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GCLMP48507 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GCLMP48507 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GCLMP48507 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GCLMP48507 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GCLMP48507 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GCLMP48507 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GCLMP48507 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GCLMP48507 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
GCLMP48507 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GCLMP48507 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GCLMP48507 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GCLMP48507 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms