Protein–RNA interactions for Protein: P48058

GRIA4, Glutamate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA4P48058 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIA4P48058 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIA4P48058 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIA4P48058 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIA4P48058 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIA4P48058 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIA4P48058 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIA4P48058 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIA4P48058 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIA4P48058 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIA4P48058 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIA4P48058 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GRIA4P48058 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GRIA4P48058 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GRIA4P48058 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GRIA4P48058 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GRIA4P48058 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GRIA4P48058 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GRIA4P48058 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GRIA4P48058 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GRIA4P48058 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GRIA4P48058 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GRIA4P48058 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GRIA4P48058 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
GRIA4P48058 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GRIA4P48058 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GRIA4P48058 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GRIA4P48058 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GRIA4P48058 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GRIA4P48058 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
GRIA4P48058 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GRIA4P48058 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GRIA4P48058 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GRIA4P48058 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GRIA4P48058 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GRIA4P48058 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GRIA4P48058 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
GRIA4P48058 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
GRIA4P48058 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GRIA4P48058 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
GRIA4P48058 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GRIA4P48058 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GRIA4P48058 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GRIA4P48058 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
GRIA4P48058 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
GRIA4P48058 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GRIA4P48058 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GRIA4P48058 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GRIA4P48058 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GRIA4P48058 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GRIA4P48058 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GRIA4P48058 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GRIA4P48058 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GRIA4P48058 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GRIA4P48058 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GRIA4P48058 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GRIA4P48058 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GRIA4P48058 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GRIA4P48058 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GRIA4P48058 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GRIA4P48058 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GRIA4P48058 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GRIA4P48058 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GRIA4P48058 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GRIA4P48058 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
GRIA4P48058 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GRIA4P48058 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GRIA4P48058 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GRIA4P48058 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GRIA4P48058 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GRIA4P48058 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GRIA4P48058 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GRIA4P48058 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GRIA4P48058 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GRIA4P48058 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GRIA4P48058 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GRIA4P48058 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
GRIA4P48058 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GRIA4P48058 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GRIA4P48058 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
GRIA4P48058 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
GRIA4P48058 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GRIA4P48058 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GRIA4P48058 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GRIA4P48058 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
GRIA4P48058 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GRIA4P48058 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GRIA4P48058 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GRIA4P48058 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GRIA4P48058 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GRIA4P48058 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GRIA4P48058 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GRIA4P48058 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GRIA4P48058 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GRIA4P48058 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GRIA4P48058 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GRIA4P48058 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GRIA4P48058 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GRIA4P48058 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GRIA4P48058 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms