Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATRXP46100 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATRXP46100 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATRXP46100 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATRXP46100 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATRXP46100 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATRXP46100 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATRXP46100 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATRXP46100 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATRXP46100 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATRXP46100 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATRXP46100 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATRXP46100 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATRXP46100 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATRXP46100 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATRXP46100 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATRXP46100 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATRXP46100 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ATRXP46100 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATRXP46100 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATRXP46100 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATRXP46100 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATRXP46100 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATRXP46100 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATRXP46100 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATRXP46100 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATRXP46100 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATRXP46100 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATRXP46100 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATRXP46100 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATRXP46100 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATRXP46100 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATRXP46100 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATRXP46100 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATRXP46100 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATRXP46100 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATRXP46100 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATRXP46100 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATRXP46100 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATRXP46100 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATRXP46100 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATRXP46100 AL606763.1-201ENST00000629535 462 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATRXP46100 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATRXP46100 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATRXP46100 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATRXP46100 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATRXP46100 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATRXP46100 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATRXP46100 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATRXP46100 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATRXP46100 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATRXP46100 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATRXP46100 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATRXP46100 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATRXP46100 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATRXP46100 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATRXP46100 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATRXP46100 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATRXP46100 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATRXP46100 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATRXP46100 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATRXP46100 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ATRXP46100 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATRXP46100 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ATRXP46100 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATRXP46100 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATRXP46100 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATRXP46100 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ATRXP46100 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATRXP46100 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATRXP46100 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATRXP46100 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATRXP46100 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATRXP46100 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATRXP46100 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATRXP46100 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ATRXP46100 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATRXP46100 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATRXP46100 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATRXP46100 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATRXP46100 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATRXP46100 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATRXP46100 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATRXP46100 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATRXP46100 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATRXP46100 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATRXP46100 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATRXP46100 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATRXP46100 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ATRXP46100 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATRXP46100 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATRXP46100 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATRXP46100 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATRXP46100 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATRXP46100 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATRXP46100 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATRXP46100 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATRXP46100 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATRXP46100 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATRXP46100 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms