Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PPARGP37231 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PPARGP37231 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PPARGP37231 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PPARGP37231 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PPARGP37231 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PPARGP37231 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PPARGP37231 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PPARGP37231 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PPARGP37231 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PPARGP37231 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PPARGP37231 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PPARGP37231 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PPARGP37231 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PPARGP37231 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PPARGP37231 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PPARGP37231 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PPARGP37231 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PPARGP37231 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PPARGP37231 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PPARGP37231 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PPARGP37231 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PPARGP37231 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PPARGP37231 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PPARGP37231 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PPARGP37231 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PPARGP37231 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PPARGP37231 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PPARGP37231 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PPARGP37231 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PPARGP37231 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PPARGP37231 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PPARGP37231 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PPARGP37231 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PPARGP37231 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PPARGP37231 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PPARGP37231 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PPARGP37231 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PPARGP37231 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PPARGP37231 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PPARGP37231 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PPARGP37231 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PPARGP37231 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PPARGP37231 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PPARGP37231 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PPARGP37231 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PPARGP37231 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PPARGP37231 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PPARGP37231 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PPARGP37231 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PPARGP37231 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PPARGP37231 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PPARGP37231 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PPARGP37231 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PPARGP37231 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PPARGP37231 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PPARGP37231 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PPARGP37231 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PPARGP37231 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PPARGP37231 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PPARGP37231 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PPARGP37231 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PPARGP37231 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PPARGP37231 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PPARGP37231 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PPARGP37231 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PPARGP37231 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PPARGP37231 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PPARGP37231 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PPARGP37231 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PPARGP37231 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PPARGP37231 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PPARGP37231 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PPARGP37231 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PPARGP37231 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PPARGP37231 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PPARGP37231 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PPARGP37231 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PPARGP37231 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PPARGP37231 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PPARGP37231 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PPARGP37231 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PPARGP37231 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PPARGP37231 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PPARGP37231 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PPARGP37231 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PPARGP37231 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PPARGP37231 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PPARGP37231 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PPARGP37231 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PPARGP37231 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PPARGP37231 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PPARGP37231 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PPARGP37231 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PPARGP37231 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PPARGP37231 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PPARGP37231 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PPARGP37231 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PPARGP37231 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PPARGP37231 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms