Protein–RNA interactions for Protein: P35968

KDR, Vascular endothelial growth factor receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDRP35968 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KDRP35968 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KDRP35968 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KDRP35968 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KDRP35968 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KDRP35968 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KDRP35968 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KDRP35968 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KDRP35968 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KDRP35968 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
KDRP35968 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KDRP35968 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KDRP35968 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KDRP35968 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KDRP35968 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
KDRP35968 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KDRP35968 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KDRP35968 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KDRP35968 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KDRP35968 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KDRP35968 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
KDRP35968 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KDRP35968 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KDRP35968 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KDRP35968 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KDRP35968 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KDRP35968 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KDRP35968 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KDRP35968 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KDRP35968 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
KDRP35968 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
KDRP35968 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
KDRP35968 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDRP35968 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDRP35968 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDRP35968 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDRP35968 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDRP35968 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDRP35968 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDRP35968 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDRP35968 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDRP35968 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDRP35968 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDRP35968 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
KDRP35968 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDRP35968 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDRP35968 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDRP35968 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
KDRP35968 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDRP35968 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDRP35968 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDRP35968 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDRP35968 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDRP35968 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDRP35968 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDRP35968 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDRP35968 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDRP35968 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDRP35968 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDRP35968 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KDRP35968 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KDRP35968 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KDRP35968 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KDRP35968 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
KDRP35968 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
KDRP35968 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KDRP35968 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KDRP35968 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KDRP35968 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KDRP35968 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KDRP35968 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KDRP35968 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KDRP35968 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KDRP35968 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KDRP35968 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KDRP35968 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KDRP35968 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KDRP35968 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KDRP35968 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KDRP35968 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KDRP35968 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KDRP35968 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KDRP35968 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KDRP35968 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KDRP35968 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KDRP35968 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KDRP35968 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KDRP35968 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KDRP35968 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KDRP35968 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KDRP35968 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KDRP35968 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KDRP35968 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KDRP35968 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KDRP35968 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KDRP35968 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KDRP35968 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KDRP35968 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KDRP35968 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KDRP35968 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms