Protein–RNA interactions for Protein: P35712

SOX6, Transcription factor SOX-6, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX6P35712 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SOX6P35712 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SOX6P35712 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SOX6P35712 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SOX6P35712 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SOX6P35712 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SOX6P35712 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SOX6P35712 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SOX6P35712 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SOX6P35712 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
SOX6P35712 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SOX6P35712 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SOX6P35712 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SOX6P35712 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SOX6P35712 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SOX6P35712 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SOX6P35712 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SOX6P35712 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SOX6P35712 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SOX6P35712 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SOX6P35712 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SOX6P35712 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SOX6P35712 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SOX6P35712 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SOX6P35712 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SOX6P35712 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SOX6P35712 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SOX6P35712 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SOX6P35712 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SOX6P35712 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SOX6P35712 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SOX6P35712 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SOX6P35712 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SOX6P35712 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SOX6P35712 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SOX6P35712 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SOX6P35712 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SOX6P35712 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SOX6P35712 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SOX6P35712 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SOX6P35712 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SOX6P35712 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SOX6P35712 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SOX6P35712 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SOX6P35712 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SOX6P35712 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SOX6P35712 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SOX6P35712 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SOX6P35712 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SOX6P35712 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SOX6P35712 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SOX6P35712 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SOX6P35712 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SOX6P35712 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SOX6P35712 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SOX6P35712 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SOX6P35712 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOX6P35712 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOX6P35712 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOX6P35712 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOX6P35712 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOX6P35712 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOX6P35712 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOX6P35712 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOX6P35712 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOX6P35712 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOX6P35712 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOX6P35712 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOX6P35712 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOX6P35712 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOX6P35712 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOX6P35712 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOX6P35712 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOX6P35712 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOX6P35712 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOX6P35712 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOX6P35712 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOX6P35712 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOX6P35712 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOX6P35712 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOX6P35712 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOX6P35712 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOX6P35712 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOX6P35712 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOX6P35712 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOX6P35712 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOX6P35712 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOX6P35712 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOX6P35712 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOX6P35712 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOX6P35712 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOX6P35712 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOX6P35712 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOX6P35712 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOX6P35712 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOX6P35712 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOX6P35712 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOX6P35712 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOX6P35712 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOX6P35712 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms