Protein–RNA interactions for Protein: P35247

SFTPD, Pulmonary surfactant-associated protein D, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPDP35247 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms