Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXC13P31276 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms