Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXA13P31271 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXA13P31271 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXA13P31271 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXA13P31271 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXA13P31271 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXA13P31271 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXA13P31271 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXA13P31271 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXA13P31271 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXA13P31271 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXA13P31271 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXA13P31271 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXA13P31271 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXA13P31271 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXA13P31271 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXA13P31271 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXA13P31271 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXA13P31271 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXA13P31271 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXA13P31271 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXA13P31271 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXA13P31271 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXA13P31271 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXA13P31271 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXA13P31271 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXA13P31271 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXA13P31271 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXA13P31271 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXA13P31271 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXA13P31271 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXA13P31271 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXA13P31271 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXA13P31271 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXA13P31271 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXA13P31271 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXA13P31271 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXA13P31271 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXA13P31271 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXA13P31271 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXA13P31271 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXA13P31271 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXA13P31271 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXA13P31271 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXA13P31271 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXA13P31271 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXA13P31271 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXA13P31271 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXA13P31271 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXA13P31271 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXA13P31271 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXA13P31271 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXA13P31271 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXA13P31271 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXA13P31271 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXA13P31271 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXA13P31271 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXA13P31271 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXA13P31271 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXA13P31271 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXA13P31271 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXA13P31271 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXA13P31271 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXA13P31271 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXA13P31271 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXA13P31271 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXA13P31271 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXA13P31271 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXA13P31271 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXA13P31271 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXA13P31271 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXA13P31271 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXA13P31271 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXA13P31271 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXA13P31271 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXA13P31271 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXA13P31271 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXA13P31271 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXA13P31271 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXA13P31271 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXA13P31271 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXA13P31271 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXA13P31271 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXA13P31271 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXA13P31271 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXA13P31271 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXA13P31271 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXA13P31271 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HOXA13P31271 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
HOXA13P31271 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HOXA13P31271 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HOXA13P31271 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HOXA13P31271 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
HOXA13P31271 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HOXA13P31271 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
HOXA13P31271 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
HOXA13P31271 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HOXA13P31271 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
HOXA13P31271 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC19.45■□□□□ 0.7
HOXA13P31271 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms