Protein–RNA interactions for Protein: P28223

HTR2A, 5-hydroxytryptamine receptor 2A, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR2AP28223 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HTR2AP28223 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HTR2AP28223 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HTR2AP28223 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HTR2AP28223 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HTR2AP28223 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HTR2AP28223 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HTR2AP28223 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HTR2AP28223 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HTR2AP28223 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HTR2AP28223 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HTR2AP28223 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HTR2AP28223 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HTR2AP28223 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HTR2AP28223 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HTR2AP28223 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HTR2AP28223 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HTR2AP28223 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HTR2AP28223 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HTR2AP28223 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HTR2AP28223 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HTR2AP28223 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HTR2AP28223 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HTR2AP28223 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HTR2AP28223 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HTR2AP28223 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HTR2AP28223 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HTR2AP28223 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HTR2AP28223 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HTR2AP28223 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HTR2AP28223 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HTR2AP28223 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HTR2AP28223 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HTR2AP28223 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HTR2AP28223 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HTR2AP28223 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HTR2AP28223 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HTR2AP28223 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HTR2AP28223 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HTR2AP28223 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HTR2AP28223 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HTR2AP28223 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HTR2AP28223 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HTR2AP28223 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HTR2AP28223 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HTR2AP28223 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HTR2AP28223 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HTR2AP28223 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HTR2AP28223 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HTR2AP28223 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HTR2AP28223 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HTR2AP28223 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HTR2AP28223 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HTR2AP28223 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HTR2AP28223 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HTR2AP28223 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HTR2AP28223 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.4 ms