Protein–RNA interactions for Protein: P25791

LMO2, Rhombotin-2, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2P25791 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LMO2P25791 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
LMO2P25791 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LMO2P25791 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LMO2P25791 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LMO2P25791 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LMO2P25791 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LMO2P25791 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LMO2P25791 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
LMO2P25791 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LMO2P25791 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LMO2P25791 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LMO2P25791 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LMO2P25791 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LMO2P25791 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LMO2P25791 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LMO2P25791 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LMO2P25791 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LMO2P25791 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
LMO2P25791 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LMO2P25791 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LMO2P25791 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LMO2P25791 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
LMO2P25791 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LMO2P25791 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LMO2P25791 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LMO2P25791 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LMO2P25791 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LMO2P25791 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LMO2P25791 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LMO2P25791 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LMO2P25791 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LMO2P25791 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LMO2P25791 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LMO2P25791 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LMO2P25791 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LMO2P25791 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LMO2P25791 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LMO2P25791 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LMO2P25791 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
LMO2P25791 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LMO2P25791 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LMO2P25791 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LMO2P25791 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LMO2P25791 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LMO2P25791 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LMO2P25791 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LMO2P25791 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LMO2P25791 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LMO2P25791 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LMO2P25791 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LMO2P25791 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LMO2P25791 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LMO2P25791 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
LMO2P25791 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LMO2P25791 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LMO2P25791 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LMO2P25791 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LMO2P25791 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LMO2P25791 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LMO2P25791 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LMO2P25791 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
LMO2P25791 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LMO2P25791 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LMO2P25791 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LMO2P25791 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LMO2P25791 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LMO2P25791 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LMO2P25791 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LMO2P25791 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
LMO2P25791 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LMO2P25791 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
LMO2P25791 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LMO2P25791 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LMO2P25791 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
LMO2P25791 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
LMO2P25791 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LMO2P25791 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
LMO2P25791 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LMO2P25791 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LMO2P25791 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LMO2P25791 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LMO2P25791 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LMO2P25791 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LMO2P25791 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LMO2P25791 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LMO2P25791 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LMO2P25791 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LMO2P25791 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LMO2P25791 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LMO2P25791 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LMO2P25791 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LMO2P25791 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LMO2P25791 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LMO2P25791 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LMO2P25791 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMO2P25791 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMO2P25791 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMO2P25791 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMO2P25791 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms