Protein–RNA interactions for Protein: P21860

ERBB3, Receptor tyrosine-protein kinase erbB-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERBB3P21860 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ERBB3P21860 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ERBB3P21860 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ERBB3P21860 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ERBB3P21860 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ERBB3P21860 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ERBB3P21860 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ERBB3P21860 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ERBB3P21860 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ERBB3P21860 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
ERBB3P21860 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ERBB3P21860 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
ERBB3P21860 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
ERBB3P21860 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ERBB3P21860 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ERBB3P21860 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ERBB3P21860 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ERBB3P21860 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ERBB3P21860 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ERBB3P21860 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ERBB3P21860 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ERBB3P21860 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ERBB3P21860 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ERBB3P21860 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ERBB3P21860 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERBB3P21860 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERBB3P21860 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERBB3P21860 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERBB3P21860 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERBB3P21860 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERBB3P21860 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERBB3P21860 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERBB3P21860 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERBB3P21860 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ERBB3P21860 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERBB3P21860 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERBB3P21860 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERBB3P21860 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERBB3P21860 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERBB3P21860 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERBB3P21860 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERBB3P21860 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERBB3P21860 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERBB3P21860 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERBB3P21860 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERBB3P21860 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERBB3P21860 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERBB3P21860 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERBB3P21860 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERBB3P21860 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERBB3P21860 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERBB3P21860 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERBB3P21860 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERBB3P21860 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ERBB3P21860 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERBB3P21860 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ERBB3P21860 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERBB3P21860 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERBB3P21860 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERBB3P21860 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERBB3P21860 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERBB3P21860 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERBB3P21860 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERBB3P21860 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERBB3P21860 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERBB3P21860 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERBB3P21860 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERBB3P21860 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERBB3P21860 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERBB3P21860 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERBB3P21860 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERBB3P21860 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERBB3P21860 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERBB3P21860 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERBB3P21860 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERBB3P21860 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERBB3P21860 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ERBB3P21860 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERBB3P21860 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERBB3P21860 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERBB3P21860 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERBB3P21860 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERBB3P21860 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERBB3P21860 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERBB3P21860 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERBB3P21860 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERBB3P21860 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERBB3P21860 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERBB3P21860 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERBB3P21860 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERBB3P21860 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERBB3P21860 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERBB3P21860 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERBB3P21860 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERBB3P21860 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERBB3P21860 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERBB3P21860 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERBB3P21860 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERBB3P21860 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERBB3P21860 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms