Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
LMNB1P20700 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
LMNB1P20700 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
LMNB1P20700 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
LMNB1P20700 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
LMNB1P20700 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LMNB1P20700 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LMNB1P20700 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LMNB1P20700 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LMNB1P20700 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LMNB1P20700 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LMNB1P20700 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LMNB1P20700 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LMNB1P20700 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LMNB1P20700 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LMNB1P20700 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LMNB1P20700 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LMNB1P20700 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LMNB1P20700 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LMNB1P20700 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LMNB1P20700 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
LMNB1P20700 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LMNB1P20700 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
LMNB1P20700 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LMNB1P20700 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LMNB1P20700 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LMNB1P20700 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LMNB1P20700 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LMNB1P20700 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LMNB1P20700 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LMNB1P20700 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LMNB1P20700 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LMNB1P20700 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LMNB1P20700 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LMNB1P20700 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LMNB1P20700 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LMNB1P20700 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LMNB1P20700 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LMNB1P20700 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
LMNB1P20700 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LMNB1P20700 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LMNB1P20700 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
LMNB1P20700 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LMNB1P20700 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
LMNB1P20700 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LMNB1P20700 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LMNB1P20700 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
LMNB1P20700 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LMNB1P20700 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LMNB1P20700 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
LMNB1P20700 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
LMNB1P20700 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LMNB1P20700 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
LMNB1P20700 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
LMNB1P20700 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LMNB1P20700 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LMNB1P20700 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LMNB1P20700 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LMNB1P20700 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
LMNB1P20700 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LMNB1P20700 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LMNB1P20700 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LMNB1P20700 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LMNB1P20700 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LMNB1P20700 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LMNB1P20700 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
LMNB1P20700 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LMNB1P20700 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LMNB1P20700 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LMNB1P20700 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LMNB1P20700 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LMNB1P20700 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LMNB1P20700 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LMNB1P20700 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LMNB1P20700 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LMNB1P20700 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LMNB1P20700 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LMNB1P20700 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
LMNB1P20700 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LMNB1P20700 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LMNB1P20700 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LMNB1P20700 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LMNB1P20700 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LMNB1P20700 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LMNB1P20700 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LMNB1P20700 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LMNB1P20700 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
LMNB1P20700 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LMNB1P20700 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LMNB1P20700 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
LMNB1P20700 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LMNB1P20700 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LMNB1P20700 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LMNB1P20700 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LMNB1P20700 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LMNB1P20700 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
LMNB1P20700 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LMNB1P20700 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LMNB1P20700 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LMNB1P20700 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms