Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms