Protein–RNA interactions for Protein: P19397

CD53, Leukocyte surface antigen CD53, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD53P19397 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD53P19397 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD53P19397 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD53P19397 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD53P19397 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD53P19397 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD53P19397 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD53P19397 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD53P19397 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD53P19397 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD53P19397 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD53P19397 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD53P19397 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD53P19397 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD53P19397 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD53P19397 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD53P19397 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD53P19397 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD53P19397 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD53P19397 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD53P19397 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD53P19397 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD53P19397 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD53P19397 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD53P19397 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CD53P19397 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD53P19397 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD53P19397 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD53P19397 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD53P19397 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CD53P19397 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD53P19397 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD53P19397 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD53P19397 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD53P19397 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD53P19397 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD53P19397 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD53P19397 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD53P19397 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD53P19397 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD53P19397 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD53P19397 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD53P19397 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD53P19397 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD53P19397 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD53P19397 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD53P19397 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD53P19397 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD53P19397 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD53P19397 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD53P19397 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD53P19397 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD53P19397 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD53P19397 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD53P19397 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CD53P19397 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD53P19397 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD53P19397 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD53P19397 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD53P19397 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD53P19397 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD53P19397 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD53P19397 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD53P19397 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD53P19397 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD53P19397 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD53P19397 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD53P19397 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD53P19397 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD53P19397 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD53P19397 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD53P19397 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD53P19397 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD53P19397 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CD53P19397 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD53P19397 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD53P19397 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD53P19397 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CD53P19397 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD53P19397 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD53P19397 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD53P19397 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD53P19397 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD53P19397 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD53P19397 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD53P19397 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD53P19397 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD53P19397 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CD53P19397 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD53P19397 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD53P19397 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD53P19397 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD53P19397 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD53P19397 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD53P19397 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD53P19397 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD53P19397 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD53P19397 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD53P19397 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD53P19397 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms