Protein–RNA interactions for Protein: P18847

ATF3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF3P18847 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATF3P18847 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATF3P18847 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATF3P18847 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATF3P18847 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATF3P18847 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATF3P18847 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATF3P18847 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATF3P18847 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATF3P18847 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATF3P18847 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATF3P18847 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATF3P18847 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATF3P18847 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ATF3P18847 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATF3P18847 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATF3P18847 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATF3P18847 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATF3P18847 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATF3P18847 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ATF3P18847 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATF3P18847 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATF3P18847 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATF3P18847 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATF3P18847 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATF3P18847 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATF3P18847 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATF3P18847 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATF3P18847 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATF3P18847 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATF3P18847 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATF3P18847 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATF3P18847 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATF3P18847 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATF3P18847 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATF3P18847 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATF3P18847 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATF3P18847 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATF3P18847 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATF3P18847 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATF3P18847 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ATF3P18847 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATF3P18847 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATF3P18847 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATF3P18847 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATF3P18847 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ATF3P18847 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATF3P18847 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATF3P18847 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATF3P18847 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATF3P18847 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATF3P18847 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATF3P18847 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATF3P18847 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ATF3P18847 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATF3P18847 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATF3P18847 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATF3P18847 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATF3P18847 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATF3P18847 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATF3P18847 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATF3P18847 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATF3P18847 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATF3P18847 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATF3P18847 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATF3P18847 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATF3P18847 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATF3P18847 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATF3P18847 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATF3P18847 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATF3P18847 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ATF3P18847 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ATF3P18847 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATF3P18847 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATF3P18847 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATF3P18847 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATF3P18847 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATF3P18847 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATF3P18847 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATF3P18847 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATF3P18847 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATF3P18847 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATF3P18847 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ATF3P18847 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATF3P18847 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATF3P18847 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATF3P18847 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATF3P18847 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATF3P18847 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ATF3P18847 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATF3P18847 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATF3P18847 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATF3P18847 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATF3P18847 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATF3P18847 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATF3P18847 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
ATF3P18847 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
ATF3P18847 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATF3P18847 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATF3P18847 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.8 ms