Protein–RNA interactions for Protein: P13727

PRG2, Bone marrow proteoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG2P13727 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRG2P13727 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRG2P13727 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRG2P13727 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRG2P13727 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PRG2P13727 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRG2P13727 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRG2P13727 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRG2P13727 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRG2P13727 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRG2P13727 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRG2P13727 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRG2P13727 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRG2P13727 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PRG2P13727 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PRG2P13727 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PRG2P13727 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRG2P13727 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRG2P13727 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRG2P13727 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRG2P13727 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRG2P13727 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRG2P13727 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRG2P13727 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRG2P13727 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRG2P13727 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRG2P13727 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRG2P13727 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRG2P13727 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRG2P13727 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRG2P13727 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRG2P13727 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRG2P13727 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRG2P13727 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRG2P13727 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRG2P13727 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRG2P13727 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRG2P13727 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRG2P13727 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRG2P13727 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRG2P13727 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRG2P13727 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRG2P13727 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRG2P13727 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRG2P13727 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRG2P13727 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRG2P13727 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRG2P13727 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRG2P13727 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRG2P13727 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRG2P13727 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRG2P13727 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PRG2P13727 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRG2P13727 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRG2P13727 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRG2P13727 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRG2P13727 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRG2P13727 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRG2P13727 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PRG2P13727 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRG2P13727 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRG2P13727 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRG2P13727 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRG2P13727 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRG2P13727 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRG2P13727 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRG2P13727 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRG2P13727 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRG2P13727 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRG2P13727 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRG2P13727 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRG2P13727 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRG2P13727 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRG2P13727 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRG2P13727 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRG2P13727 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRG2P13727 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRG2P13727 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRG2P13727 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRG2P13727 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRG2P13727 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRG2P13727 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRG2P13727 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRG2P13727 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRG2P13727 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRG2P13727 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRG2P13727 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRG2P13727 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PRG2P13727 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRG2P13727 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRG2P13727 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRG2P13727 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRG2P13727 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRG2P13727 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRG2P13727 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRG2P13727 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRG2P13727 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRG2P13727 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRG2P13727 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRG2P13727 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
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