Protein–RNA interactions for Protein: P13569

CFTR, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, humanhuman

Predictions only

Length 1,480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFTRP13569 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CFTRP13569 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
CFTRP13569 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CFTRP13569 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CFTRP13569 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CFTRP13569 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CFTRP13569 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CFTRP13569 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
CFTRP13569 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
CFTRP13569 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CFTRP13569 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CFTRP13569 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CFTRP13569 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CFTRP13569 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CFTRP13569 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CFTRP13569 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CFTRP13569 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CFTRP13569 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CFTRP13569 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CFTRP13569 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CFTRP13569 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CFTRP13569 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CFTRP13569 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CFTRP13569 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CFTRP13569 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CFTRP13569 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CFTRP13569 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CFTRP13569 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CFTRP13569 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CFTRP13569 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CFTRP13569 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CFTRP13569 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CFTRP13569 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CFTRP13569 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CFTRP13569 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CFTRP13569 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CFTRP13569 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CFTRP13569 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CFTRP13569 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CFTRP13569 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CFTRP13569 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CFTRP13569 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CFTRP13569 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CFTRP13569 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CFTRP13569 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
CFTRP13569 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CFTRP13569 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CFTRP13569 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CFTRP13569 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CFTRP13569 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CFTRP13569 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CFTRP13569 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CFTRP13569 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CFTRP13569 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CFTRP13569 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CFTRP13569 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CFTRP13569 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CFTRP13569 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CFTRP13569 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CFTRP13569 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CFTRP13569 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
CFTRP13569 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CFTRP13569 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CFTRP13569 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CFTRP13569 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CFTRP13569 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CFTRP13569 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CFTRP13569 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
CFTRP13569 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CFTRP13569 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CFTRP13569 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CFTRP13569 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CFTRP13569 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
CFTRP13569 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CFTRP13569 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CFTRP13569 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CFTRP13569 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
CFTRP13569 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
CFTRP13569 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
CFTRP13569 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CFTRP13569 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
CFTRP13569 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CFTRP13569 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CFTRP13569 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CFTRP13569 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
CFTRP13569 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
CFTRP13569 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
CFTRP13569 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
CFTRP13569 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CFTRP13569 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CFTRP13569 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CFTRP13569 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CFTRP13569 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CFTRP13569 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CFTRP13569 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CFTRP13569 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CFTRP13569 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CFTRP13569 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CFTRP13569 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CFTRP13569 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms