Protein–RNA interactions for Protein: P13224

GP1BB, Platelet glycoprotein Ib beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BBP13224 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GP1BBP13224 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms