Protein–RNA interactions for Protein: P12270

TPR, Nucleoprotein TPR, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRP12270 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TPRP12270 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TPRP12270 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TPRP12270 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TPRP12270 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TPRP12270 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TPRP12270 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TPRP12270 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TPRP12270 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TPRP12270 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TPRP12270 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TPRP12270 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TPRP12270 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TPRP12270 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TPRP12270 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
TPRP12270 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TPRP12270 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TPRP12270 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TPRP12270 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TPRP12270 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
TPRP12270 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TPRP12270 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TPRP12270 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TPRP12270 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TPRP12270 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TPRP12270 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TPRP12270 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
TPRP12270 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TPRP12270 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TPRP12270 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TPRP12270 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TPRP12270 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TPRP12270 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TPRP12270 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TPRP12270 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TPRP12270 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TPRP12270 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TPRP12270 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TPRP12270 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TPRP12270 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TPRP12270 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TPRP12270 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TPRP12270 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TPRP12270 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TPRP12270 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TPRP12270 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TPRP12270 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TPRP12270 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TPRP12270 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
TPRP12270 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TPRP12270 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TPRP12270 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TPRP12270 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TPRP12270 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TPRP12270 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TPRP12270 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TPRP12270 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TPRP12270 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TPRP12270 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TPRP12270 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TPRP12270 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TPRP12270 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TPRP12270 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TPRP12270 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TPRP12270 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TPRP12270 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TPRP12270 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TPRP12270 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TPRP12270 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TPRP12270 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TPRP12270 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TPRP12270 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TPRP12270 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TPRP12270 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TPRP12270 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TPRP12270 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TPRP12270 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TPRP12270 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TPRP12270 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TPRP12270 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TPRP12270 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TPRP12270 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TPRP12270 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TPRP12270 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TPRP12270 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TPRP12270 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TPRP12270 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TPRP12270 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TPRP12270 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TPRP12270 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TPRP12270 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TPRP12270 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TPRP12270 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TPRP12270 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TPRP12270 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TPRP12270 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TPRP12270 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TPRP12270 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TPRP12270 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TPRP12270 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms