Protein–RNA interactions for Protein: P11686

SFTPC, Pulmonary surfactant-associated protein C, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPCP11686 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
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