Protein–RNA interactions for Protein: P10826

RARB, Retinoic acid receptor beta, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARBP10826 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
RARBP10826 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RARBP10826 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RARBP10826 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RARBP10826 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RARBP10826 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RARBP10826 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RARBP10826 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
RARBP10826 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RARBP10826 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RARBP10826 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RARBP10826 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RARBP10826 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RARBP10826 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RARBP10826 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RARBP10826 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RARBP10826 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RARBP10826 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RARBP10826 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
RARBP10826 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
RARBP10826 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
RARBP10826 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RARBP10826 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RARBP10826 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RARBP10826 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RARBP10826 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RARBP10826 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RARBP10826 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RARBP10826 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RARBP10826 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RARBP10826 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RARBP10826 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RARBP10826 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RARBP10826 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RARBP10826 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
RARBP10826 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
RARBP10826 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RARBP10826 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RARBP10826 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RARBP10826 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RARBP10826 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RARBP10826 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RARBP10826 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RARBP10826 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RARBP10826 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RARBP10826 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RARBP10826 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RARBP10826 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RARBP10826 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RARBP10826 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RARBP10826 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RARBP10826 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RARBP10826 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RARBP10826 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RARBP10826 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RARBP10826 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RARBP10826 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RARBP10826 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RARBP10826 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RARBP10826 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RARBP10826 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RARBP10826 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RARBP10826 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RARBP10826 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RARBP10826 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RARBP10826 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RARBP10826 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RARBP10826 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RARBP10826 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
RARBP10826 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RARBP10826 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
RARBP10826 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RARBP10826 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RARBP10826 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RARBP10826 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RARBP10826 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RARBP10826 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RARBP10826 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RARBP10826 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RARBP10826 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RARBP10826 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RARBP10826 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RARBP10826 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RARBP10826 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RARBP10826 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RARBP10826 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RARBP10826 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RARBP10826 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RARBP10826 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RARBP10826 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RARBP10826 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RARBP10826 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RARBP10826 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RARBP10826 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RARBP10826 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RARBP10826 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RARBP10826 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RARBP10826 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RARBP10826 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RARBP10826 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms